Laut Congressional Budget Office hat die F35 C aber auch die höchsten Betriebs- und Wartungskosten pro Flugzeug und Flugstunde. Die verfügbarkeitsrate hat sich zwar verbessert aber trotzdem war beispielsweise die durchschnittliche Verfügbarkeitsrate einer sieben Jahre alten F-35A etwas gleich hoch wie die einer 36 Jahre alten F-16C/D und einer 17 Jahre alten F-22.